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Avaliação de modelos para estimativa de componentes de (co)variância em características reprodutivas de suínos R. Bras. Zootec.
Pires,Aldrin Vieira; Lopes,Paulo Sávio; Torres,Robledo de Almeida; Euclydes,Ricardo Frederico; Regazzi,Adair José; Costa,André Ribeiro Corrêa da.
Foram analisados dados de características reprodutivas de três raças de suínos, Duroc, Landrace e Large White, para avaliar a importância de inclusão dos efeitos genético materno e comum de leitegada em modelos animais. As características tamanho de leitegada ao nascimento, tamanho de leitegada ao desmame, peso de leitegada ao nascimento, peso de leitegada aos 21 dias de idade e taxa de mortalidade foram avaliadas pelo método da máxima verossimilhança restrita (REML), obtendo-se um valor de verossimilhança para cada característica e raça. O teste da razão de verossimilhança foi aplicado para se verificar qual o modelo mais adequado na avaliação genética animal: o modelo 1, que continha o efeito genético direto; o modelo 2, que continha os efeitos genéticos...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Efeito materno; Modelo animal; REML; Teste da razão de verossimilhança.
Ano: 2000 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982000000600013
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Avaliação genética para peso corporal em um rebanho Nelore Arq. Bras. Med. Vet. Zootec.
Gonçalves,F.M; Pires,A.V; Pereira,I.G; Garcia,D.A; Farah,M.M; Meira,C.T; Cruz,V.A.R.
Estimaram-se as herdabilidades para os efeitos genéticos direto e materno e as correlações genéticas entre essas variáveis para os pesos ao desmame (P205), ao ano (P365) e ao sobreano (P550) em um rebanho Nelore do norte de Minas Gerais. O modelo estatístico incluiu os efeitos aditivos direto e materno, os efeitos fixos de grupo de contemporâneos (fazenda, sexo, regime alimentar, estação (seca e água) e ano de nascimento do animal) e o efeito da covariável idade da vaca ao parto (linear e quadrático). Os componentes de variância e os valores genéticos foram estimados utilizando-se o método REML. A tendência genética foi obtida utilizando-se a regressão do valor genético médio anual em relação ao ano de nascimento dos animais. As estimativas de...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Bovino de corte; Tendência genética; Herdabilidade; REML.
Ano: 2011 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352011000100024
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Comparação de metodologias para estimação de parâmetros genéticos em população de aves submetida à seleção Arq. Bras. Med. Vet. Zootec.
Azevedo Jr,P.C.; Silva,M.A.; Fridrich,A.B.; Lopes,P.S.; Euclydes,R.F.; Torres,R.A; Duarte,R.G.; Teixeira,L.V..
O trabalho utilizou peso corporal de 11.700 aves de corte e conversão alimentar de 2.400 aves e produção de pintos de 560 fêmeas selecionadas para reprodução, em cada uma de quatro gerações de seleção (1992-1995) para comparar estimativas de parâmetros genéticos obtidas por meio do Método III de Henderson, incluindo todas as observações disponíveis de peso corporal no 42º dia de idade (PC), conversão alimentar (CA) e produção de pintos (PP) com as obtidas pela máxima verossimilhança restrita - REM, em diferentes composições de arquivos, definidos em: 1 - análise de uma geração de seleção com todas as informações (RUC) de PC, CA e PP; 2 - análise de duas gerações de seleção incluindo ou não PP; 3 - análise de três gerações de seleção incluindo ou não PP; e...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Ave de corte; Estimativa; Parâmetro genético; REML; Henderson.
Ano: 2002 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352002000500010
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Covarianzas genéticas y fenotípicas para días abiertos y características de la curva de lactancia en vacas Holstein en el norte de México Veterinaria México
López-Ordaz,Reyes; Castillo-Juárez,Héctor; Montaldo,Hugo H..
El objetivo de este estudio fue estimar covarianzas genéticas y fenotípicas para características de la curva de lactancia y días abiertos en vacas Holstein. Los datos incluyeron 1 579 lactancias de 766 vacas, hijas de 126 sementales, en un hato en el norte de México. Las características estudiadas por lactancia fueron días abiertos (DO), producción máxima de leche (PMÁX), días a la producción máxima (DPMÁX), producción de leche de 305 días (MP305), persistencia de la lactancia por Wood (PERSW), persistencia de Wood expresada como logaritmo natural (LNPERSW) y persistencia medida como ((producción al día 305/PMÁX) x 100) (PERS). Los componentes de covarianza fueron obtenidos mediante el uso de modelos univariados y bivariados con máxima verosimilitud...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Ganado lechero; Parámetros genéticos; Producción máxima de leche; Producción de leche; Persistencia de la lactancia; Modelo animal; REML.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.org.mx/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0301-50922009000400001
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Desempenho genotípico de linhagens de arroz de terras altas utilizando metodologia de modelos mistos Bragantia
Borges,Vanderley; Soares,Antonio Alves; Reis,Moizés Souza; Resende,Marcos Deon Vilela; Cornélio,Vanda Maria Oliveira; Leite,Natália Alves; Vieira,Antonio Rodrigues.
Avaliou-se o desempenho de genótipos de arroz de terras altas utilizando metodologia de modelos mistos. Foram utilizados dados de produtividade de grãos dos ensaios de valor de cultivo e uso (VCU) do programa cooperativo de melhoramento de arroz de terras altas, desenvolvido em Minas Gerais, no período de 1997/1998 a 2007/2008. Realizou-se análise de deviance para verificar a significância dos efeitos de genótipos e suas interações com locais e anos, obtendo-se a estabilidade e a adaptabilidade genotípicas, com os métodos da média harmônica dos valores genotípicos. Os efeitos de genótipos, genótipos x locais e genótipos x anos foram estatisticamente significativos (p<0,05). As linhagens e cultivares mais estáveis foram: Curinga-3, CNA 8983, Guarani,...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Oryza sativa; REML; BLUP; Estabilidade genotípica; Adaptabilidade.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0006-87052010000400008
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Estimação de componentes de variância sob influência de genes de efeito principal, comparando-se metodologias Bayesiana e clássica sob diferentes cenários R. Bras. Zootec.
Assis,Giselle Mariano Lessa de; Carneiro Júnior,José Marques; Euclydes,Ricardo Frederico; Torres,Robledo de Almeida; Lopes,Paulo Sávio.
Quatro diferentes tipos de população foram simulados com o objetivo de verificar a influência de genes de efeito principal e do tamanho da população na estimação de componentes de variância sob seleção. A estimação foi realizada por meio da utilização e comparação das metodologias clássica e Bayesiana (a Bayesiana com três níveis de informação a priori). As metodologias REML e Bayesiana com prior não-informativo, em geral, produziram resultados bastante semelhantes. Em populações cuja característica é governada por genes de efeito principal, as estimativas dos componentes de variância genética aditiva foram pouco acuradas, exceto quando se utilizou metodologia Bayesiana com prior informativo. A inclusão das informações de parentesco e dos registros de...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Amostragem de Gibbs; Modelo infinitesimal; Modelos mistos; REML; Simulação computacional; Viés da seleção.
Ano: 2007 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982007000600007
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Estimação de parâmetros genéticos de características reprodutivas em suínos R. Bras. Zootec.
Pires,Aldrin Vieira; Lopes,Paulo Sávio; Torres,Robledo de Almeida; Euclydes,Ricardo Frederico; Costa,André Ribeiro Corrêa da.
Com o objetivo de estimar os parâmetros genéticos e fenotípicos de características reprodutivas de suínos, foram utilizados dados de peso da leitegada ao nascimento (PLN), peso da leitegada ajustado para 21 dias (PL21), tamanho de leitegada ao nascimento (TLN), tamanho de leitegada ao desmame (TLD) e taxa de mortalidade (TM), de três raças de suínos, Duroc, Landrace e Large White. Variâncias e covariâncias genéticas e fenotípicas foram estimadas pelo Método da Máxima Verossimilhança Restrita (REML), usando modelo que inclui os efeitos genéticos direto e materno e comum de leitegada. Estes componentes foram usados para calcular as herdabilidades direta (<img src="http:/img/fbpe/rbz/v29n6/5698fr7.gif">), materna (<img...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Efeito materno; Leitegada; Modelo animal; REML; Suíno.
Ano: 2000 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982000000600015
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Estimação de parâmetros genéticos de medidas de conformação, produção de leite e idade ao primeiro parto em vacas da raça Gir Leiteiro R. Bras. Zootec.
Wenceslau,Amauri Arias; Lopes,Paulo Sávio; Teodoro,Roberto Luiz; Verneque,Rui da Silva; Euclydes,Ricardo Frederico; Ferreira,William José; Silva,Martinho de Almeida e.
RESUMO - Foram utilizados 573 registros zootécnicos de vacas primíparas da raça Gir Leiteiro para estimar os componentes de (co)variância das características de conformação, produção de leite em até 305 dias de lactação (PLEI) e idade ao primeiro parto (IPP) pelo Método da Máxima Verossimilhança Restrita (REML). Esses componentes foram utilizados no cálculo dos coeficientes de herdabilidade e nas correlações genéticas, fenotípicas e residuais. As medidas de conformação, circunferência torácica (CTOR), altura na garupa (AG), comprimento corporal (CC), comprimento de tetas (CT), diâmetro de tetas (DT) e altura de úbere (AU) foram realizadas em vacas à primeira lactação, com idade média de 4,05 anos. As correlações genéticas e fenotípicas entre PLEI e IPP...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Bovino de leite; Correlação genética; Raça Gir; REML.
Ano: 2000 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982000000100021
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Estimação de parâmetros genéticos em características de desempenho de suínos das raças Large White, Landrace e Duroc R. Bras. Zootec.
Costa,André Ribeiro Corrêa da; Lopes,Paulo Sávio; Torres,Robledo de Almeida; Regazzi,Adair José; Silva,Martinho de Almeida e; Euclydes,Ricardo Frederico; Pires,Aldrin Vieira.
Dados de suínos Large White (LW), Landrace (LD) e Duroc (DU) foram utilizados na estimação dos componentes de variância para peso ajustado aos 70 dias (PA70), ganho de peso diário (GPD) e espessura de toucinho (ET). Os componentes de (co)variância foram estimados pelo método de máxima verossimilhança restrita (REML). Esses componentes foram utilizados no cálculo das estimativas das herdabilidades, do efeito comum de leitegada e das correlações genéticas, de leitegada e residual. As características apresentaram valores de herdabilidades de médio a alto, indicando a possibilidade de ganhos genéticos por meio de seleção. As correlações genéticas entre PA70 e GPD (LW = 0,46; LD = 0,08; e DU = -0,47) e entre PA70 e ET (LW = 0,48; LD = 0,31; e DU = 0,47) indicam...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Parâmetros genéticos; REML; Suíno.
Ano: 2001 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982001000100009
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Estimação de parâmetros genéticos em tamanho de leitegada de suínos utilizando análises de características múltiplas R. Bras. Zootec.
Barbosa,Leandro; Lopes,Paulo Sávio; Regazzi,Adair José; Torres,Robledo de Almeida; Santana Junior,Mário Luiz; Veroneze,Renata.
Registros de animais da raça Large White foram utilizados para estimar componentes de co-variâncias e parâmetros genéticos para a característica número de leitões nascidos como medida do tamanho de leitegada. Na obtenção dos componentes de co-variâncias e dos parâmetros genéticos, utilizou-se o método da Máxima Verossimilhança Restrita, com o algoritmo Livre de Derivadas, por meio do programa MTDFREML. O modelo misto continha o efeito fixo de grupo contemporâneo e os efeitos aleatórios genético aditivo direto e residual. Dados das primeiras quatro parições foram usados em duas análises: análises unicaracterísticas e análise multicaracterística separada em séries de análises bicaracterísticas, na qual cada parição foi tratada como característica diferente....
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Características reprodutivas; Correlação genética; Herdabilidade; Número de leitões nascidos; REML.
Ano: 2008 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982008001100007
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Estimating variance components in Stata AgEcon
Marchenko, Yulia V..
This article gives a brief overview of the popular methods for estimating variance components in linear models and describes several ways to obtain such estimates in Stata for various experimental designs. The article’s emphasis is on using xtmixed to estimate variance components. Prior to Stata 9, loneway could be used to estimate variance components for one-way random-effects models. For other experimental designs, variance components could be computed manually using saved results after anova. The latter approach is viable but requires tedious computations for complicated experimental designs. Instead, as of Stata 9, variance components are easily obtained by using xtmixed.
Tipo: Journal Article Palavras-chave: Variance components; Experimental design; ANOVA; REML; ML; Multilevel; Random coefficients; Mixed models; Research Methods/ Statistical Methods.
Ano: 2005 URL: http://purl.umn.edu/117553
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Estimation of variance components, genetic parameters and genetic trends for litter size of swines R. Bras. Zootec.
Barbosa,Leandro; Lopes,Paulo Sávio; Regazzi,Adair José; Torres,Robledo de Almeida; Santana Júnior,Mário Luiz; Veroneze,Renata.
Records of Large White breed animals were used to estimate variance components, genetic parameters and trends for the character total number of born piglets (TNBP) as measure of litter size. For obtaining variance components and genetic parameters, it was used the Restricted Maximum Likelihood Method using MTDFREML software. Two mixed models (additive and repeatability) were evaluated. The additive model contained fixed effect of the contemporary group and the following random effects: direct additive genetic and residual effect for the first parturition. Repeatability model had the same effects of the additive model plus parturition order fixed effect and non-correlated animal permanent environment random effect for the second, third and forth...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Genetic trend; Heritability; Number of piglets; REML; Repeatability model; Reproductive traits.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982010001000008
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Estimativa de parâmetros genéticos para características de carcaça em um rebanho de suínos Large White R. Bras. Zootec.
Fernandez Giné,Gastón Andrés; Freitas,Rilke Tadeu Fonseca de; Oliveira,Antonio Ilson Gomes de; Pereira,Idalmo Garcia; Gonçalves,Tarcísio de Moraes.
Com o objetivo de estimar parâmetros genéticos para características de carcaça de suínos, foram utilizados dados de rendimento de carcaça (RC), comprimentos de carcaça pelo método Brasileiro (CCMB) e pelo método americano (CCMA), espessuras de toucinho média (ETM) e a 6,5 cm da linha dorsal (P2), área de olho de lombo (AOL), relação carne:gordura (RCG), rendimento de pernil (RP), porcentagens de carne (PC), gordura (PG) e cortes magros (PCM), relação peso da gordura/peso da carne (RGC) e taxa de crescimento em músculo (TCM), obtidos de 711 suínos Large White. Os componentes de (co)variância foram estimados pelo método da Máxima Verossimilhança Restrita (REML), incluindo no modelo efeitos fixos (sexo e grupo contemporâneo) e aleatórios (efeitos genéticos e...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Parâmetros genéticos; REML; Suínos; Carcaça.
Ano: 2004 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982004000200009
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Estimativas de parâmetros e tendências genéticas para algumas características de importância econômica em linhagem paterna de frangos de corte sob seleção R. Bras. Zootec.
Vayego,Stela Adami; Dionello,Nelson José Laurino; Figueiredo,Elsio Antonio Pereira de.
Estimativas dos parâmetros genéticos e fenotípicos de algumas características produtivas em linhagem paterna de matrizes de frango de corte foram obtidas utilizando-se a metodologia de modelos mistos. Utilizaram-se dados de aproximadamente 46.000 aves, originados de 12 gerações no período de 1992 a 2003, fornecidos pela EMBRAPA Suínos e aves. Nos machos foram avaliadas as características peso corporal aos 42 dias de idade (P42), comprimento de peito (CPeito), largura maior do peito (Larg1) e largura menor do peito (Larg2) aos 42 dias de idade. Os componentes de variância e co-variância foram estimados utilizando-se o programa DFREML. As estimativas de herdabilidade obtidas foram moderadas e variaram de 0,29 a 0,53. As correlações genéticas foram: 0,68...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Matrizes de frango de corte; Modelos mistos; Parâmetros genéticos; REML; Tendência genética.
Ano: 2008 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982008000700013
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Evaluation of Top-Cross Popcorn Hybrids Using Mixed Linear Model Methodology Chilean J. Agric. Res.
Arnhold,Emmanuel; Mora,Freddy; G. Silva,Ricardo; I.V. Good-God,Pedro; Rodovalho,Marcos A.
The market for popcorn (Zea mays L.) has been continuously growing in Brazil fact has required the development of cultivars adapted to local environmental conditions. For this reason, the analytical objectives of this study were to evaluate top-cross popcorn hybrids in relation to popping expansion and grain yield in three different eco-geographic regions of Brazil, in order to estimate variance components using Restricted Maximum Likelihood (REML) and predict breeding values using Best Linear Unbiased Prediction (BLUP). Genetic evaluation considered a linear model with heterogeneous residual (environmental) variances. The Restricted Likelihood Ratio Test (RLRT) evidenced significant differences (p < 0.01) for the genotypic effect. Grain yield showed a...
Tipo: Journal article Palavras-chave: Popping expansion; REML; BLUP; Improvement.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0718-58392009000100006
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Multivariate spatial statistical analysis of multiple experiments and longitudinal data. Infoteca-e
RESENDE, M. D. V. de; THOMPSON, R..
bitstream/item/162207/1/Doc-90.pdf
Tipo: Documentos (INFOTECA-E) Palavras-chave: REML; BLUP; Melhoramento genético.; Genética; Análise Estatística; Melhoramento; Método; Planta; Seleção..
Ano: 2003 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/309230
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Parental selection in diallel crosses of Jatropha curcas using mixed models Agronomy
Laviola, Bruno Galvêas; Teodoro, Paulo Eduardo; Peixoto, Leonardo de Azevedo; Bhering, Leonardo Lopes.
Diallel crosses in an unbalanced scheme were carried out in Jatropha to (i) evaluate the additive and non-additive genetic components; (ii) select parents through the general combining ability; (iii) estimate the specific combining ability used in the crosses; and (iv) verify the existence of the maternal effect and inbreeding depression. The experiment was carried out in a complete diallel scheme with four progenitors, unbalanced for the number of crosses. The experimental design consisted of a randomized block, with 5 replications and 3 plants per plot. The following characteristics were evaluated: stem diameter (SD), number of branches (NB), plant height (PH), canopy projection on the row (CPR), canopy projection between rows (CPB), mass of hundred...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Ciências Agrárias combining ability; REML; BLUP; Plant breeding. Melhoramento vegetal.
Ano: 2018 URL: http://periodicos.uem.br/ojs/index.php/ActaSciAgron/article/view/35008
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Parental selection in diallel crosses of Jatropha curcas using mixed models Agronomy
Laviola, Bruno Galvêas; Teodoro, Paulo Eduardo; Peixoto, Leonardo de Azevedo; Bhering, Leonardo Lopes.
Diallel crosses in an unbalanced scheme were carried out in Jatropha to (i) evaluate the additive and non-additive genetic components; (ii) select parents through the general combining ability; (iii) estimate the specific combining ability used in the crosses; and (iv) verify the existence of the maternal effect and inbreeding depression. The experiment was carried out in a complete diallel scheme with four progenitors, unbalanced for the number of crosses. The experimental design consisted of a randomized block, with 5 replications and 3 plants per plot. The following characteristics were evaluated: stem diameter (SD), number of branches (NB), plant height (PH), canopy projection on the row (CPR), canopy projection between rows (CPB), mass of hundred...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Combining ability; REML; BLUP; Plant breeding.; Melhoramento vegetal.
Ano: 2018 URL: http://periodicos.uem.br/ojs/index.php/ActaSciAgron/article/view/35008
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Prediction of genotypic values and estimation of genetic parameters in common bean BABT
Chiorato,Alisson Fernando; Carbonell,Sérgio Augusto Morais; Dias,Luiz Antônio dos Santos; Resende,Marcos Deon Vilela de.
Eighteen common bean (Phaseolus vulgaris L.) genotypes were evaluated in 25 environments of the state of São Paulo in 2001 and 2002. The estimation of genetic parameters by the Restricted Maximum Likelihood (REML) and the prediction of genotypic values via Best Linear Unbiased Prediction (BLUP) were obtained by software Selegen-REML/BLUP. The estimate of the broad-sense heritability was low for the grain yield (0.03), since it took individual plots into consideration and was free of the effects of interaction with years, cultivation periods and site. Nevertheless, the heritability at the level of line means across the various environments was high (0.75), allowing a high accuracy (0.87) in the selection of lines for planting in the environment mean. Among...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: REML; BLUP; Phaseolus vulgaris; Mixed Models.
Ano: 2008 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-89132008000300005
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Seleção de genótipos de amendoim forrageiro para cobertura do solo e produção de biomassa aérea no período de estabelecimento utilizando-se metodologia de modelos mistos R. Bras. Zootec.
Assis,Giselle Mariano Lessa de; Valentim,Judson Ferreira; Carneiro Júnior,José Marques; Azevedo,José Marlo Araújo de; Ferreira,Aliedson Sampaio.
Objetivou-se estimar parâmetros genéticos e selecionar genótipos de amendoim forrageiro para maior cobertura do solo e produção de biomassa aérea durante o período de estabelecimento nas condições ambientais do Acre. A área experimental foi estabelecida em dezembro de 2005. O experimento foi realizado em delineamento de blocos ao acaso com quatro repetições utilizando-se 21 genótipos de amendoim forrageiro, incluindo três cultivares (Amarillo, Alqueire 1 e Belmonte). A seleção dos genótipos foi realizada considerando a cobertura do solo e a produção de matéria seca. As avaliações de cobertura do solo foram realizadas entre janeiro e outubro de 2006, em intervalos de quatro semanas. A produção de matéria seca foi mensurada 304 dias após o plantio. Os...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Arachis; BLUP; Dados longitudinais; Leguminosas forrageiras; Parâmetros genéticos; REML.
Ano: 2008 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982008001100001
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